进口药品清关操作流程如下：
准备阶段
- 企业资质准备6：进口企业需具有进出口经营权，以及中药材或中药饮片的营业执照经营范围，持有《进口药品注册证》《药品生产许可证》或《药品经营许可证》，并完成海关无纸化签约、海关企业年报申报、电子委托协议签约（首次进口办理）。
- 文件资料准备1：包括进口药品注册证或医药产品注册证、药品经营许可证或药品生产许可证和营业执照、进口药品检验报告书、进口药品通关单、原产地证、出厂检验报告书、合同、发票、箱单、提单等。
进口备案
- 网上申请：进口单位向允许药品进口的口岸所在地药品监督管理部门提交资料，通过网上审批系统进行申请。申请提交的证照类申报材料应是原件或者加盖企业公章的复印件的电子材料，其他的应是加盖企业公章的电子材料，电子材料应清晰可见1。
- 审核与通知：省药品监督管理局依法对网上申请进行审查，通过网上审批系统向申请人发出补正材料、受理、不予受理等电子通知书。申请人在系统提示审批结束后，可按照审批结果公告要求，通过邮寄送达或直接到省政务服务中心窗口领取的方式，领取办理结果1。
货物到港及清关
- 换单：药品到达中国口岸后，进口商需要凭提单等相关单证到船公司或航空公司换取小提单（提货单）3。
- 报关报检：进口商或其代理向海关和检验检疫部门进行申报，提交相关文件资料，包括报关单、进口药品通关单、原产地证、合同、发票、箱单等。海关和检验检疫部门会对申报内容进行审核3。
- 查验：海关和检验检疫部门可能会对进口药品进行查验，包括货物的包装、标签、数量、质量等方面的检查，以确保货物与申报内容相符，并且符合相关法规和标准的要求。同时，药品检验机构会按照规定对进口药品进行抽查检验1。
- 缴税：根据相关法规，进口药品需要缴纳进口关税和进口环节增值税。进口商需要根据海关出具的税单，按时缴纳相应的税款4。
- 放行：在完成上述各项手续，且货物经检验检疫合格、税款缴纳完毕后，海关会予以放行。进口商可以安排将药品提离海关监管场所，运输配送到目的地9。
后续事项
进口商还需要向当地政府和药监局汇报进口药品的相关情况，包括进口量、销售情况和质量问题等2。此外，如果进口的药品需要在国内进行销售、使用等，还需要按照相关规定办理国内的销售许可证、注册证等证明文件
